Геномика растений

Роль геномики в эффективной и ускоренной селекции трудно переоценить. Получение экспертных знаний в технологиях геномного анализа и геномного редактирование, и применение полученных фундаментальных знаний и технических лабораторных навыков для эффективной и ускоренной селекции садовых культур является необходимым требованиям профессиональной подготовки для выпускников аграрных вузов по программе «Биотехнология и селекция растений».  В соответствии с целью дисциплины и запросом АПК, студенты должны освоить фундаментальные основы современной геномики и ее практическое применение, включающие: структуру геномов, организацию генов и некодирующей ДНК в геноме, мобильные элементы, размеры геномов, особенности геномов растений, маркеры на основе михондриальной и хлоропластной ДНК для определения типа ЦМС, маркирование генов, вовлеченных в ЦМС с использованием с высокоразрешающего плавления ДНК, использование высоконасыщенного генотипирования полиморфизмов одиночных фрагментов (SNP) для прогнозирования селекционной ценности, принципы подготовки растительного материала для секвенирования и обработки результатов секвенирования с использованием программ FASTQC, pycoQC и multiQC, и фильтрация данных с использованием программы Trimmomatic, а также уметь работать с геномами путем внесения целенаправленных изменений с использованием геномного редактирования.

Мы становимся свидетелями быстрого создания методов геномного редактирования, что выведет селекцию совершенно на другой уровень развития. Вместо многолетних трудо- и время затратных скрещиваний и отборов, можно будет сразу вносить целенаправленные изменения в последовательность генов создавая новые комбинации аллелей. Знание механизмов геномного редактирования (выключение, вырезание гена, изменение гена, добавление гена),   способов доставки   системы   CRISPR/Cas9 в растительную клетку,  методов анализа событий редактирования позволят создавать генотипы с высокой урожайностью, устойчивостью к фитопатогенам и заданными вкусовыми качествами.